O conselho administrativo é o órgão deliberativo em matéria administrativo-financeira do agrupamento.

O conselho administrativo do Agrupamento de Escolas Monte da Lua é constituído:

1. pela diretora, Ana Teresa Louro, que preside,
2. pela subdiretora, Cristina Moura,
3. e pelo chefe de serviços de administração escolar, Carlos Pena.